Matthijs Hardijk speelde in de jeugd van VV Hoogezand en FC Groningen. In 2016 vertrok hij naar de amateurclub Harkemase Boys, waar hij één seizoen in de Derde divisie zaterdag speelde. In 2017 vertrok hij naar Jong AZ, wat in de Eerste divisie uitkomt. Hij debuteerde in het betaald voetbal op 18 augustus 2017, in de met 1-3 gewonnen uitwedstrijd tegen FC Den Bosch. Hardijk kwam in de 72e minuut in het veld voor Abdel Malek El Hasnaoui. Na één seizoen bij Jong AZ vertrok hij naar Jong FC Groningen, waarmee hij in de Derde divisie zaterdag speelde. Na een seizoen vertrok hij in 2019 bij Jong Groningen en sloot hij bij hoofdklasser ACV aan. Sinds 2020 speelt hij voor HHC Hardenberg.